Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms