Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms