Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms