Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF3Q3KNV8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms