Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms