Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRFIP1Q32MZ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms