Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms