Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PPP1R3AQ16821 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPP1R3AQ16821 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms