Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms