Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NREPQ16612 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NREPQ16612 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NREPQ16612 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms