Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FXNQ16595 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FXNQ16595 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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FXNQ16595 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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FXNQ16595 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXNQ16595 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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