Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SSX1Q16384 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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