Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms