Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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