Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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