Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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IRF4Q15306 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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IRF4Q15306 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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