Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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