Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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