Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms