Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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