Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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