Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGB1Q14028 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms