Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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