Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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