Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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