Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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