Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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TSTA3Q13630 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSTA3Q13630 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms