Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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