Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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