Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PTGDRQ13258 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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