Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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