Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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