Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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