Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF5AQ12840 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF5AQ12840 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms