Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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