Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YOR333CYOR333C 417 nt1.96□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 DOT6YER088C 2013 nt1.96□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YLR149CYLR149C 2193 nt1.96□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 CRM1YGR218W 3255 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 RIC1YLR039C 3171 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YDL152WYDL152W 366 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 VPS8YAL002W 3825 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 MET18YIL128W 3099 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YNL144CYNL144C 2223 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 TRL1YJL087C 2484 nt1.95□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YDR286CYDR286C 345 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 MRPL31YKL138C 396 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YAR053WYAR053W 297 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 PGA1YNL158W 597 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 RPL32YBL092W 393 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 PAN3YKL025C 2040 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 SSQ1YLR369W 1974 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 MGA2YIR033W 3342 nt1.94□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 TIM13YGR181W 318 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 PHS1YJL097W 654 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YBL083CYBL083C 426 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 PEP3YLR148W 2757 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 RTT101YJL047C 2529 nt1.93□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YBL073WYBL073W 312 nt1.92□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 MYO2YOR326W 4725 nt1.92□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 HSL1YKL101W 4557 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 MNE1YOR350C 1992 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 RPA34YJL148W 702 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YKL083WYKL083W 615 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YAF9YNL107W 681 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 IRC23YOR044W 474 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 PKH3YDR466W 2697 nt1.91□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 YBR184WYBR184W 1572 nt1.9□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 SEF1YBL066C 3447 nt1.9□□□□□ -2.1
LSP1Q12230 RTT107YHR154W 3213 nt1.89□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 TOF2YKR010C 2316 nt1.89□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 AIM9YER080W 1884 nt1.89□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 RPL40BYKR094C 387 nt1.89□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YLR053CYLR053C 327 nt1.89□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 ATG11YPR049C 3537 nt1.88□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YDL062WYDL062W 426 nt1.88□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YJR011CYJR011C 786 nt1.88□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 TIM18YOR297C 579 nt1.88□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 BIL1YOR304C-A 231 nt1.88□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 SMY1YKL079W 1971 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 MNL2YLR057W 2550 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YDR008CYDR008C 351 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 RPL42BYHR141C 321 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 RPL42AYNL162W 321 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YPL229WYPL229W 621 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YBP1YBR216C 2025 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YDR341CYDR341C 1824 nt1.87□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 HER1YOR227W 3741 nt1.86□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 RPL37BYDR500C 267 nt1.86□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.86□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 GUP1YGL084C 1683 nt1.86□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 PLC1YPL268W 2610 nt1.86□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 CFT2YLR115W 2580 nt1.85□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YCR043CYCR043C 384 nt1.85□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 ABM1YJR108W 372 nt1.85□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YNL114CYNL114C 372 nt1.85□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 PAC1YOR269W 1485 nt1.85□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 BPH1YCR032W 6504 nt1.85□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 SLM1YIL105C 2061 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 SBE22YHR103W 2559 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YDR102CYDR102C 333 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 PRE4YFR050C 801 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 RPS27AYKL156W 249 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 YBR174CYBR174C 315 nt1.84□□□□□ -2.11
LSP1Q12230 MYO4YAL029C 4416 nt1.84□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 SYH1YPL105C 2550 nt1.84□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 IRR1YIL026C 3453 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 CAT2YML042W 2013 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 NHP2YDL208W 471 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YHL041WYHL041W 450 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 TMA10YLR327C 261 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YNL146WYNL146W 303 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 SAR1YPL218W 573 nt1.83□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 SGO1YOR073W 1773 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 CSN9YDR179C 489 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YKL118WYKL118W 312 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 YKL136WYKL136W 399 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 OSH6YKR003W 1347 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 PEX8YGR077C 1770 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 RKM1YPL208W 1752 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 SNF5YBR289W 2718 nt1.82□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 UBP1YDL122W 2430 nt1.81□□□□□ -2.12
LSP1Q12230 PXA2YKL188C 2562 nt1.81□□□□□ -2.12
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