Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 SAP4YGL229C 2457 nt3.84□□□□□ -1.79
WSC3Q12215 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt3.84□□□□□ -1.79
WSC3Q12215 UBP14YBR058C 2346 nt3.84□□□□□ -1.79
WSC3Q12215 YPL150WYPL150W 2706 nt3.84□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.83□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.83□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.83□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.83□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YPP1YGR198W 2454 nt3.83□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 NET1YJL076W 3570 nt3.83□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 NPR3YHL023C 3441 nt3.82□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YKL225WYKL225W 348 nt3.82□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 PEP5YMR231W 3090 nt3.82□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 RRP12YPL012W 3687 nt3.82□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 HOS3YPL116W 2094 nt3.82□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 MET10YFR030W 3108 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 EGT2YNL327W 3126 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 MMS22YLR320W 4365 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 snR76snR76 109 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YDR210WYDR210W 228 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 RGM1YMR182C 636 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 CRS5YOR031W 210 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 DNL4YOR005C 2835 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 VID27YNL212W 2349 nt3.81□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YLR041WYLR041W 321 nt3.8□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 PTP2YOR208W 2253 nt3.8□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 MLH1YMR167W 2310 nt3.79□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 ALK1YGL021W 2283 nt3.79□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 SPT4YGR063C 309 nt3.79□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 SNC1YAL030W 354 nt3.79□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 IKI3YLR384C 4050 nt3.79□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 ORC1YML065W 2745 nt3.79□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.78□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YOL075CYOL075C 3885 nt3.78□□□□□ -1.8
WSC3Q12215 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.77□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 KAP95YLR347C 2586 nt3.77□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.76□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 RPO21YDL140C 5202 nt3.76□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 EAF1YDR359C 2949 nt3.75□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 SNA2YDR525W-A 240 nt3.75□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt3.75□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 PSK2YOL045W 3306 nt3.74□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 MNN4YKL201C 3537 nt3.74□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 RAD5YLR032W 3510 nt3.73□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 DIP2YLR129W 2832 nt3.73□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 SEN1YLR430W 6696 nt3.73□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 VAC7YNL054W 3498 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 GLC3YEL011W 2115 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 ANB1YJR047C 474 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 YLR232WYLR232W 348 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 KTI11YBL071W-A 249 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 PRP22YER013W 3438 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 CAF130YGR134W 3369 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 SEG1YMR086W 2883 nt3.72□□□□□ -1.81
WSC3Q12215 RPL37BYDR500C 267 nt3.71□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 NFT1YKR103W 3657 nt3.7□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 DUG2YBR281C 2637 nt3.7□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 PAU11YGL261C 363 nt3.7□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 TAF5YBR198C 2397 nt3.7□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 USA1YML029W 2517 nt3.7□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 YME2YMR302C 2553 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 RGA2YDR379W 3030 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 TAH1YCR060W 336 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 RIC1YLR039C 3171 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 MAK21YDR060W 3078 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 ULS1YOR191W 4860 nt3.69□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 INP52YNL106C 3552 nt3.68□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 UBP15YMR304W 3693 nt3.68□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 ITC1YGL133W 3795 nt3.68□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 NEW1YPL226W 3591 nt3.68□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 MTR4YJL050W 3222 nt3.68□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 RPM2YML091C 3609 nt3.68□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 YTA7YGR270W 4140 nt3.67□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt3.67□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 AKL1YBR059C 3327 nt3.67□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 SMC2YFR031C 3513 nt3.67□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 APL4YPR029C 2499 nt3.66□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 RSF2YJR127C 4143 nt3.65□□□□□ -1.82
WSC3Q12215 MCM7YBR202W 2538 nt3.65□□□□□ -1.83
WSC3Q12215 PNC1YGL037C 651 nt3.65□□□□□ -1.83
WSC3Q12215 ZDS2YML109W 2829 nt3.65□□□□□ -1.83
WSC3Q12215 SLN1YIL147C 3663 nt3.65□□□□□ -1.83
WSC3Q12215 RAD1YPL022W 3303 nt3.64□□□□□ -1.83
WSC3Q12215 TMA17YDL110C 453 nt3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms