Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms