Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPAL4Q0D2K0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms