Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf54Q08AI8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C2orf54Q08AI8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms