Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK1Q08629 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms