Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXL1Q08397 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms