Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms