Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms