Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPAQ06546 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms