Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms