Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPCQ03188 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms