Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms