Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms