Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms